1．黃酮類。

黃酮類及雙黃酮類在裸子植物中普遍存在，雙黃酮除蕨類植物外很少發(fā)現(xiàn)，可以說是裸子植物的特征性成分，也是活性成分。常見的黃酮類有槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、蕓香甙(rutin)、楊梅樹皮素(myrcene)等。雙黃酮類多分布在銀杏科、柏科、杉科，如柏科植物含柏雙黃酮(cupressuflavone)，杉科和柏科含扁柏雙黃酮(hinokiflavone)，特別是穗花杉雙黃酮(amentoflavone)在裸子植物中分布最普遍。銀杏葉中含銀杏雙黃酮(ginkgetin)、異銀杏雙黃酮(isoginkgetin)、去甲銀杏雙黃酮(bilobetin)。銀杏葉總黃酮制劑用于治療冠心病。

2．生物堿類。

生物堿在裸子植物中分布不普遍，現(xiàn)知的僅存于三尖杉科、紅豆杉科、羅漢松科、麻黃科及買麻藤科。三尖杉屬(Cephalotaxus)植物含多種生物堿，現(xiàn)已分離出20多種生物堿，其中粗榧堿類(cephalotaxine type alkaloids)有12種，高刺桐堿類(homoerythrina type alkaloids)有9種。經(jīng)動物試驗，酯型生物堿有抗癌活性，如三尖杉酯堿(harringtonine)、高三尖杉酯堿(homoharrgtonine)，臨床上用于治白血病。紫杉醇(tax01)對卵巢癌、乳腺癌、子宮頸癌等有抑制作用。麻黃屬(Ephedra)植物多含有麻黃堿類生物堿(Ephedra alkaloids)，如左旋麻黃堿(l-ephedrine)、右旋偽麻黃堿(d-pseudoephedrine)。麻黃堿用于治支氣管哮喘、鼻粘膜充血引起的鼻塞。偽麻黃堿對平滑肌的解痙作用和麻黃堿相似。

3．樹脂、揮發(fā)油、有機(jī)酸等如松香、松節(jié)油。

金錢松根皮含有土模皮酸有抗真菌作用，用治腳癬、濕疹、神經(jīng)性皮炎。