中國科學(xué)院沈陽應(yīng)用生態(tài)研究所標(biāo)本館始建于1954年，是目前東北地區(qū)標(biāo)本保藏量最大、門類齊全的綜合性生物標(biāo)本館?，F(xiàn)藏有各類標(biāo)本52.1萬份。其中,維管束植物標(biāo)本26萬份，苔蘚標(biāo)本12萬份，地衣標(biāo)本3萬份，高等真菌標(biāo)本1.5萬份，昆蟲標(biāo)本6萬份，病害標(biāo)本1萬份，微生物菌種2.5萬株，木材標(biāo)本1千份及土壤標(biāo)本2萬份。此外還收藏生物分類區(qū)系方面的文獻(xiàn)資料一萬多冊。

本館現(xiàn)有研究人員8人，標(biāo)本管理人員5人。主要開展植物系統(tǒng)與進(jìn)化、植物多樣性保護(hù)和持續(xù)利用，森林病蟲害，微生物資源的系統(tǒng)學(xué)及應(yīng)用開發(fā)等方面的研究工作。建館以來，37項(xiàng)科研成果獲省部級以上獎勵，出版專著80余部，發(fā)表學(xué)術(shù)論文千余篇。本館已成為我國東北地區(qū)生物資源研究和開發(fā)利用的重要基地和東亞苔蘚植物研究中心之一。