除了正常的孢子生殖外，蕨類的根、根狀莖及葉，都能依靠產生的無性芽孢和頂端分生組織產生新植株，所以根據不同類型的蕨類植物應采取不同的繁殖方法。

分株繁殖是蕨類無性繁殖最常用也是最有效的方法。這種方法主要適用于有橫走莖或叢生的種類。分株過程很簡單，將蕨挖出后用利器分成兩個或多個獨立的植株，每個小植株至少要有1個芽，并給母株留有足夠生長的根狀莖就行了。姬蕨的地下莖蔓延很快，可在早春到夏初出現新芽時將其分株。骨碎補科植物，根總是暴露在培養(yǎng)土表面，只需切取帶有足夠根系和新芽的部分，適當剪去老葉，栽于腐殖土中，很快就能長出新根和新葉。有氣生根的蕨如槲蕨，多成叢地附生在樹干或巖石上，根狀莖肥厚，能貯存水分，分株時要保證有足夠的根。對于叢生性或直立根莖的蕨如鱗毛蕨、蹄蓋蕨等，可用利刃一分為二，分別栽植。一些特殊的蕨如鹿角蕨，會在根上或根狀莖上長出小植株，可待其長出保護葉后，用刀在其最老的保護葉上切下小植株并帶部分基部蕨葉，用鐵絲固定在蛇木板或腐爛的木板上，保持高的濕度使其恢復生長。分株后的植株都需要精心養(yǎng)護，以利于長出新根。需將每個部分剪掉過大的根系及枯葉、葉柄及受傷部位后，栽于排水良好的基質上，并適當遮蔭，保持溫濕度，特別要保護好新的拳芽和未展開的小葉，在細心養(yǎng)護下很快就能恢復生長。

有些蕨有在葉子上產生小植株的能力，這種小植株稱為珠芽。在葉子頂端著生珠芽的種類有長生鐵角蕨、單芽狗脊蕨以及過山蕨等。過山蕨每株植物會有2~3個成熟的珠芽，如弓狀彈落到地面便形成小植株，小植株長大后又能長出小珠芽，不斷地繁衍就能越過小山梁，因此得名過山蕨。在葉脈上散生小植株的種類有多鱗耳蕨，可分段切下帶小植株的葉脈，植入沙和腐殖土(3：1)混合的土壤。胎生狗脊蕨和芽孢鐵角蕨等在葉面上著生珠芽。連在母體上的珠芽可以從母本植株獲得充分的水分和養(yǎng)料，一般待其長到一定大小時，最好是生根后，才從母體分離下來。此時繁殖成活率高，可栽于沙和泥炭土混和的基質中，不要埋得過深，盆上覆蓋玻璃板或塑料薄膜，以保持空氣濕度。也有人借助于一個鐵絲圈將母體的珠芽部分固定在土面上，使之自然長成小植株，最后再與母體分開，成為獨立的小植株。

與珠芽十分相似的是芽孢，這也是一種葉上的無性繁殖芽，是松葉蕨屬和附生的石松等蕨類所特有的。在配子體發(fā)育過程中產生一群小芽孢，當它們成熟后，就會隨著雨水擴散，著生于樹皮上或土壤中。

許多蕨類能在側枝上生長出類似根的匍匐莖，大多數的匍匐莖是地生的，腎蕨屬植物的匍匐莖是氣生的，往往懸于空中，只有落到地面接觸土壤時，才能長成小植株。匍匐莖會從母體向四周延伸，這時如再用土壤壓蓋，就會產生新的芽和根。剛長出的小植株需繼續(xù)從母株上吸取水分和營養(yǎng)，所以不能急于將它與母株分離，要待其能夠自養(yǎng)獨立生存時，才能在接近母株的地方切斷匍匐莖，將小植株移到新的培養(yǎng)條件下。一般在春夏間移植成活率最高。

壓條對一些特殊的蕨是很好的方法。如對穗狀的石松及攀緣的蕨如海金沙等，將其生長部分用混合土壓蓋，芽眼處就會生根，待生長良好后分離即可。骨碎補科的一些種類地上部分有長的根狀莖，可用空中壓條方法。將濕潤的腐殖土和苔蘚用塑料薄膜包扎在莖干上，2~3個月后可以看到根開始生成，當根系布滿后，從主莖上剪下移植，就成為新植株了。對開蕨類植物也可采用壓條法繁殖，將靠近根莖的成熟的老葉片摘下，去掉死亡物質，置于消毒過的沙和泥炭土(3：1)的混合土壤中，栽植槽上面覆蓋玻璃或薄膜，在溫暖而遮蔭的條件下，1~2個月就會出現新芽，待其長出良好的根和葉時就可移于盆中。這種近似扦插的方法很有實用價值。

塊莖是地下根或匍匐莖膨大而成的變態(tài)結構，具有貯藏營養(yǎng)和再生功能。有塊莖的蕨很少，最有代表性的就是腎蕨。塊莖一般都是擁擠地著生在根狀莖上的，腎蕨的塊莖為卵圓形或球形，直徑1~2厘米，幼時外皮有亮白色鱗毛，成熟后呈褐色，塊莖肉質，白色，充滿水分。腎蕨的塊莖著生在鐵絲狀的匍匐莖上，繁殖時可切取帶有一部分匍匐莖的塊莖移栽于疏松透水的土壤中，很快就能長成新植株。

蕨類植物的無性繁殖方法還有很多，如蓮座蕨屬的植物還可通過葉耳繁殖。石松屬的一些種可通過莖尖繁殖。用組織培養(yǎng)方法可對珍稀瀕危蕨類及產生不育孢子的雜交種進行繁殖。